化學工業用冷凝器散熱性能好，否則會因冷凝溫度和相應的冷凝壓力過高，使冷水機組高壓保護裝置動作遲緩，甚至導致故障。蒸發器內冷水應循環流動，否則會因冷水溫度偏低而引起冷水溫度保護裝置動作而停止，或因蒸發溫度及相應的蒸發壓力過低而引起低壓保護裝置動作而停止，甚至造成化工冷水機組蒸發器內冷水結冰而損壞設備。

為此，工業冷水機制造商總結出冷水機組的啟動順序如下：

化學冷水機組冷卻塔風機開啟->冷卻水泵開啟->冷水泵關閉->冷水機組停止。

化學冷水機組停機程序如下：

化學冷水機組冷水機組停機-冷卻塔風機停機-冷卻水泵停機-冷卻水泵停機。

冷水機運行時都會產生振動，只是頻率與振幅大小因機組類型不同相差較大。如果有防振要求時，應選用振幅較小的冷水機，或對冷水機的基礎與管道進行減振處理。

冷卻水的水質好壞，對熱交換器的影響較大，其危及設備的作用是結垢和腐蝕，這不僅會影響到冷水機制冷量的降低，而且嚴重時會導致換熱管堵塞與破損。管道設計及安裝按常規方法進行，冷凍水泵接在冷水機組的進水管，以保證機組內的正壓和流量，并保持一定的減震效果，防止蒸發器的水因水泵停機被排掉。

產生高壓故障的原因如下：冷卻水流量不足，達不到額定水流量。主要表現是機組進出水壓力差變小(與系統投入運行之初的壓力差相比)，溫差變大。造成水流量不足的原因是系統缺水或存有空氣，解決辦法是在管道高處安裝排氣閥進行排氣;管道過濾器堵塞或選用過細，透水能力受限，應選用合適的過濾器并定期清理過濾網;水泵選用較小，與系統不配套。

冷凝器結垢或堵塞。冷凝水一般用自來水，在30℃以上時很容易結垢，而且由于冷卻塔是開式的，直接暴露在空氣中，灰塵異物很容易進入冷卻水系統，造成冷凝器臟堵，換熱面積小，效率低，而且也影響水流量。其表現是機組進出水壓力差、溫差變大，用手摸冷凝器上下溫度都很高，冷凝器出液銅管燙手。應定期對機組進行反沖洗，必要時進行化學清洗除垢。